Desde la perspectiva del usuario, las funciones más importantes de Epi Info son la capacidad para desarrollar rápidamente un cuestionario, personalizar el proceso de entrada de datos, de forma rápida introducir datos en dicho cuestionario, y luego analizar los datos. Para usos epidemiológicos, tales como la investigación de brotes, siendo capaz de crear rápidamente una pantalla de entrada de datos electrónicos y luego hacer un análisis inmediato de los datos recogidos pueden ahorrar cantidades considerables de tiempo en comparación con el uso de encuestas en papel.
Epi Info utiliza tres módulos distintos para lograr estas tareas: Diseñador de formularios, Enter, y el análisis. Otros módulos incluyen el módulo del tablero de instrumentos, un módulo de mapeo, y varias utilidades como StatCalc.
Epi Info 7 incluye una serie de funciones antropométricos nutricionales que pueden ayudar a registrar y evaluar las medidas de longitud, talla, peso, circunferencia de la cabeza, y la circunferencia del brazo para los niños y adolescentes. Pueden ser utilizados para el cálculo de percentiles y número de desviaciones estándar de la media (puntuaciones Z) usando el CDC / OMS 1978 patrón de crecimiento, CDC 2000 patrón de crecimiento, el crecimiento infantil de la OMS de Referencia, o la referencia de la OMS de 2007. Sustituye a la NutStat y los módulos EPINUT encontrados en versiones anteriores de Epi Info.
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